有时候对于合伙的公司而言结果不一定是共负盈亏，同甘共苦那样完美。很多原来亲如兄弟的合伙人在设立了公司后都是不欢而散，甚至有的要对付公堂。即使在合伙初期为了防止各种纠纷制定了公司合伙人合同，也一样避免不了的在发生纠纷时各据一词，各说各的主张。
那么在设立公司合伙人合同的时候主要要注意哪些问题，特别是为以后发生纠纷做防范和依据？首先要掌握公司合伙合同制定的主要内容。从规定的基础上建立完善的约定和协议。
公司合伙人合同第一部分为关键的组织形式，经营范围和场所，合伙名称和期限。特别是在合伙期限中的条款制定，终止合伙合同的情况是要有相关规定的，必须遵守合同对退伙原因的约定，否则不得提前终止公司合伙人合同。
第二部分具体对每个合伙人出资做阐述，这也是明确出资人权利和义务的最好表现。这也直接关系到第三部分盈利的分配，合伙公司就是为了每个合伙人的利益共同经营来获得分成，所以在公司合伙人合同中，这一部分相对尤为重要。第四部分则是职能分工和经营管理方面的条款，约定公司合伙人之间沟通和重大事项的处理办法和意见。
第五部分也是最权利和义务最重要关系条款，将合伙人对公司的债务分担做出约定。第六部分则要将入伙和退伙，以及公司合伙人合同终止的注意事项进行阐明。综上所述只有更严谨完善的公司合伙人合同做铺垫才会有更辉煌的合伙未来。